Як діагностувати бактеріальні хвороби
Метод візуального аналізу симптомів
Визначити бактеріальні хвороби візуальним методом, в більшості випадків, неможливо. Можливо тільки в тих випадках, якщо симптоми мають специфічний характер. Наявність ексудату часто вказує на бактеріальну природу некрозів.
Метод мікроскопічного аналізу з використанням фарбування
Препарат готується з тканин, які знаходяться між здоровою і ураженою тканиною. В результаті фарбування (наприклад, по Граму) дає можливість розпізнати бактеріальні клітини в тканини рослини-господаря.
мікробіологічний метод
Збудника виділяють з ураженої тканини рослини і вирощують на штучному живильному середовищі. Тільки при цьому потрібно встановити патогенність ізолятів бактерій, тобто здатність патогена викликати на рослинах, які штучно інфіковані, такі ж симптоми, які були на досліджуваному рослині в результаті природного поразки. Тобто діють відповідно до правила Роберта Коха, яке називається тріада Коха. Метод складається з трьох етапів: виділення збудника, зараження рослини і виділення з нього збудника.
серологічний метод
Суть методу така ж, як при діагностиці вірусів. Відмінності серологічної діагностики бактерій від діагностики вірусів полягає в тому що бактеріальні клітини мають крім білків, які специфічні для виду, ще й білки, які є загальними для роду і сімейства бактерій. Тому щоб отримати специфічну антисироватки використовують тільки видоспецифічі білки або антигени. Найбільш популярними серологічними методами є імуноферментний аналіз і реакція імунофлуоресценції. В наш час є доступні діаногостіческіе набори, за допомогою, яких можна ідентифікувати зараження насіння томата бактеріальним раком.
молекулярний метод
Серед діагностичних методів, які засновані на використанні поліморфізму молекули ДНК бактерій, найпоширенішим є ампліфікація видоспецифічності послідовностей ДНК в ході полімеразної ланцюгової реакції (ПЛР). Метод заснований на синтезі ( «множенні») окремих фрагментів ДНК, які характерні тільки для одного виду бактерій. Фрагмент ДНК може «множитися» в сотні, тисячі і мільйони разів, все залежить від специфіки діагностики певного виду. Далі фрагмент виявляється за допомогою електрофорезу в агарозному гелі або по флуоресценції вихідного розчину.
Метод, є досить чутливим (для діагностики буде досить 10-11 г бактеріальної ДНК), швидким (5-8 годин), високонадійним, точним (100). До недоліків можна тільки віднести високу вартість реактивів та обладнання, що тягне за собою і високу собівартість самої діагностики. Для проведення діагностики бактерій методом ПЛР, також важливо попередньо вивчити різноманітність ДНК ФПБ.